摘要：STATE 是由非盈利研究机构 Arc Institute 联合 UC 伯克利、斯坦福等高校的研究团队，推出的虚拟细胞模型。能够预测干细胞、癌细胞和免疫细胞在药物、细胞因子或遗传干预下的响应情况。其训练数据涵盖了来自近 1.7 亿个细胞的观察性数据，以及超过
STATE 是由非盈利研究机构 Arc Institute 联合 UC 伯克利、斯坦福等高校的研究团队，推出的虚拟细胞模型。能够预测干细胞、癌细胞和免疫细胞在药物、细胞因子或遗传干预下的响应情况。其训练数据涵盖了来自近 1.7 亿个细胞的观察性数据，以及超过 1 亿个细胞的干预性数据，涉及 70 种不同细胞系，并整合了 Arc 虚拟细胞图谱（Virtual Cell Atlas）中的数据。实验结果显示，State 在预测干预后转录组变化的表现显著优于当前主流方法。在 Tahoe-100M 数据集的测试中，其在区分干预效果方面提升了 50%，在识别差异表达基因方面的准确率是现有模型的 2 倍。
http://openbayes.com/console/signup?r=sony_0m6v
页面跳转后，点击右上角「克隆」，将该教程克隆至自己的容器中。
在当前页面中看到的算力资源均可以在平台一键选择使用。平台会默认选配好原教程所使用的算力资源、镜像版本，不需要再进行手动选择。点击「继续执行」，等待分配资源。
待系统分配好资源，当状态变为「运行中」后，点击「打开工作空间」，即可跳转至 Demo 页面。
双击左侧目录栏的项目名称，可以看到详细的运行步骤。模型已将相关配置都导入完成，直接运行代码即可启动。运行至「3、将单细胞 RNA 测序数据转换为嵌入表示」时模型处理时间较长，大约需要 30-40 分钟，请耐心等待。
待模型处理完成后，点击左侧「cell-eval-outdir」即可查看输出结果
部分数据如下图所示：
来源：科学学僧