摘要:4月17日,在成都举行的第三届“千种本草基因组计划”会议上,由成都中医药大学本草基因组学团队联合现代中医药海河实验室、中国医学科学院药用植物研究所、东北林业大学、湖北时珍实验室等单位共同完成的全球首个亿量级草药基因编码天然多样性成分库(GNDC)发布。作为目前
川观新闻记者 钟帆
4月17日,在成都举行的第三届“千种本草基因组计划”会议上,由成都中医药大学本草基因组学团队联合现代中医药海河实验室、中国医学科学院药用植物研究所、东北林业大学、湖北时珍实验室等单位共同完成的全球首个亿量级草药基因编码天然多样性成分库(GNDC)发布。作为目前全球规模最大的药用天然成分库,GNDC将为药物发现提供广阔的“化学空间”,加速“大数据驱动”模式下的药物发现进程。
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这个草药基因编码天然多样性成分库有何意义?
GNDC基于全球八大权威药典收录的1037个药用物种的核基因组、细胞器基因组等多维数据,一方面通过自主开发的基因组遍历算法结合转录组、小RNA测序、肽质谱等多组学技术,实现了对天然多样性成分的挖掘与验证;另一方面通过整合自然语言处理、对抗生成网络、图卷积网络等人工智能算法,实现成分的识别、分类与功能注释。
以基因之“钥”解锁本草之“谜”。GNDC收录了超过2.34亿个基因直接或间接编码的天然多样性成分,包括232万个次生代谢产物、22977万条多肽、238万个小RNA和26万个碳水化合物。它实现了基因组信息、成分信息与功能信息的整合,弥补了现有天然产物数据库在数据类型与功能解析方面的不足。
在项目总负责人中国工程院院士、成都中医药大学首席教授陈士林看来,GNDC实现了基因组数据与人工智能算法的深度融合,标志着天然成分研究进入了智能化和精准化的新阶段。通过创新性整合多组学技术与人工智能方法,GNDC在天然多样性成分的识别、分类与功能注释方面展现出了突破性优势,将成为驱动天然药物研发范式变革、加速中药现代化进程的核心技术支撑。
来源:四川日报