摘要：SCSES在诱导HSPC分化中识别活化单核细胞亚型最令研究团队兴奋的是，SCSES在肿瘤耐药机制研究中的突破——他们分析了127例多发性骨髓瘤（MM）患者的治疗前后单细胞数据，发现：传统基因表达聚类仅将细胞分为诊断组和复发组；而SCSES通过剪接异质性，进一步
SCSES在诱导HSPC分化中识别活化单核细胞亚型最令研究团队兴奋的是，SCSES在肿瘤耐药机制研究中的突破——他们分析了127例多发性骨髓瘤（MM）患者的治疗前后单细胞数据，发现：传统基因表达聚类仅将细胞分为诊断组和复发组；而SCSES通过剪接异质性，进一步将每组细分为两个亚群（如诊断组分为SC1和SC2）。进一步研究发现，SC2亚群在诊断时已具备硼替佐米（BTZ）耐药的特征：不仅表达耐药相关基因，还存在248个差异剪接事件（DSEs），涉及泛素-蛋白酶体系统（BTZ的作用靶点）。更重要的是，SC2亚群的标记基因活性与患者更差的生存期显著相关。这意味着，SCSES能在治疗前就识别出潜在耐药细胞，为临床调整治疗方案提供依据。传统基因表达分析看不到的剪接差异，恰恰是耐药的关键驱动因素。除了肿瘤研究，SCSES还在胚胎发育和造血干细胞分化中展现了强大能力：在人类胚胎干细胞向定型内胚层分化过程中，SCSES揭示了JMJD1C内含子滞留、DNMT3B外显子包含等剪接事件的动态变化，构建了RBP（如ESRP1）与剪接事件的调控网络；在小鼠造血干细胞分化数据中，SCSES识别出三个单核细胞亚群，其中一个亚群（Mono3）高表达Runx1（促进髓系分化）和中性粒细胞样基因，暗示其更快的分化速度。SCSES让我们能从转录后层面，更深刻地理解细胞异质性——无论是肿瘤的耐药进化，还是胚胎的正常发育，剪接都是关键的调控开关。原文链接：https://www.nature.com/articles/s41467-025-64517-5原标题：《性能显著提升！刘肇祺/团队开发新型计算框架单细胞水平解码RNA剪接异质性，精准识别肿瘤潜在耐药细胞》 来源：小强科普社
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