摘要:LabChip® GX Touch™核酸分析仪采用微流控毛细管电泳分离技术可以快速完成DNA和RNA的核酸片段大小及浓度检测,生成可重复的高分辨率数据。并且,采用便捷的触摸屏操作界面,即使新手,也能快速进行准备工作和样品运行,简化了传统电泳过程的诸多繁琐步骤。
作者:木子庄主
LabChip® GX Touch™核酸分析仪采用微流控毛细管电泳分离技术可以快速完成DNA和RNA的核酸片段大小及浓度检测,生成可重复的高分辨率数据。并且,采用便捷的触摸屏操作界面,即使新手,也能快速进行准备工作和样品运行,简化了传统电泳过程的诸多繁琐步骤。
一、工作原理
LabChip GX Touch检测试剂盒基于传统的凝胶电泳原理,这些原理已转换为芯片形式。芯片格式大大缩短了分离时间,并以数字格式提供自动定量信息。
该芯片包含一组互连的微通道,这些微通道连接分离通道和缓冲孔。其中一个微通道连接到一个短毛细管,该毛细管以90°角从芯片底部延伸。在测定过程中,毛细管从微孔板的孔中吸取样品。
芯片中的某些通道比其他通道大。较大的通道包含缓冲区。在芯片制备过程中,较小的通道和一些孔中填充有筛分凝胶和缓冲液。通道填满后,芯片起到集成电路的作用。
该电路由电极块中的七个电极驱动,当前门关闭时,这些电极与芯片孔中的溶液接触。每个电极都连接到一个独立的电源,可提供最大的控制和灵活性。
填充芯片中较小通道的聚合物设计用于在通过电泳驱动DNA/RNA片段或蛋白质通过其时按大小筛选DNA/RNA片段或蛋白质,类似于使用琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶。
样品和筛分缓冲液还含有荧光染料,在与双链 DNA、RNA 或蛋白质/SDS复合物结合后会变得更亮。
在芯片中,通过负压从微孔板中抽取每个样品,直到将足够数量的样品加载到芯片中。然后将样品电泳移动到中央通道中。当片段沿着中心通道向下移动时,它们按大小分离,然后通过激光,激光激发与分子结合的荧光染料。该软件绘制荧光强度随时间的关系图,并为每个样品生成电泳图。
可以在凝胶选项卡上以凝胶状格式查看数据,以实现平板凝胶的外观。(凝胶的颜色可以改变。
对于DNA、RNA、蛋白质和聚糖测定,定量浓度和准确定量每个片段的大小是通过ladder和内标确定各条带的大小和浓度。
吸入芯片的样品量取决于pH值、盐浓度和缓冲液添加剂。内部标准对这些因子进行归一化,以便软件可以使用标准品曲线面积与未知峰的比值直接确定浓度。
在各样品分析之间清洗吸管,从而消除了交叉污染或残留。
二、仪器描述
1、仪器前视图
1)Touch Screen
触摸屏:显示控制仪器的软件。
2)Power Button
电源按钮:打开仪器和触摸屏。仪器开启时亮起。要关闭仪器,请在Windows桌面上选择“开始”-->“关机”以关闭软件。使用电源按钮关闭仪器可能会导致文件损坏。仅在紧急情况下或计算机已锁定时使用。
3)Status Indicator Lights
状态指示灯:指示仪器状态。
未亮-电源关闭。
绿色常亮-电源已打开,GX Touch 软件处于活动状态,但仪器处于空闲状态。
绿色闪烁-运行检测或Protein Clear HR/Protein EXact校准。
黄色常亮-电源已打开,但GX Touch软件未在Windows中运行。
红色常亮-电源已打开,GX Touch软件处于活动状态,但无法与仪器通信。
红色闪烁-仪器无法执行LabChip GX Touch软件发出的操作。
4)Front Door
使用LabChip GX Touch软件打开前门。当门打开时,会显示一条消息,提醒用户执行适当的操作。
2、连接接口
1)电源
2)侧面连接器
侧面连接器用于将外围设备(如鼠标、键盘或外部显示器)连接到LabChip GX Touch/GXII Touch仪器,并将仪器连接到网络。
VGA Monitor Port:VGA 显示器端口,用于将仪器连接到外部显示器。
3、DNA, RNA, and Protein Chips
1)Top of Chip
2)Bottom of Chip
3)芯片接口
芯片接口固定芯片,为芯片通道提供电压以加载、进样和分离样品,提供压力以用分离凝胶灌注芯片,并为芯片孔提供真空以将样品从微孔板吸入芯片。芯片接口还包含一个加热元件,用于在芯片的微流控通道中保持恒定温度,并提供光学黑光束转储,以提高灵敏度并帮助荧光检测。
Lid:固定电极和O形圈以提供电压和对芯片施加压力。
Optics lens:用于激光照亮芯片的透镜。
Optical Beam Dump:在芯片下方提供光学暗背景。
Pressure Plate with Heating Element:在芯片的微流控通道中保持恒定的温度。
Electrodes:向芯片施加电压,使流体通过芯片,并驱动芯片通道中的电泳分离。
O-Rings:在芯片接口盖和芯片之间建立密封,以对孔施加压力或真空。
Pressure Port:提供压力(正压或负压)以灌注芯片或将样品移过芯片。
4)核酸Chips
5)蛋白Chips
4、微孔板载体
三、软件介绍
1、LabChip GX Touch主窗口
1)Views
“视图”按钮 - 打开“视图”窗口以查看上次完成运行的数据。使用LabChip GX Reviewer软件查看或分析先前运行的数据。
2)Prime and Calibrate Window
Change Assay Folder:更改检测文件夹按钮,轻触以选择包含所需检测的文件夹。
Prme and Calibrate:启动和校准按钮,开始校准过程。
2、Run Window
1)elect Wells Tab
Import Run File:“导入运行文件”按钮,打开“从XML文件导入运行参数”窗口以选择要导入的运行文件。
2)Setup Run Tab
Skip Warm:跳过热,仅显示 Protein EXact 芯片在运行前已预热的情况。如果选择此选项,则不会重复预热过程。
3)Start Run Tab
Chip Status:芯片状态,显示检测类型、芯片试剂过期时间、芯片过期日期和芯片寿命。
4)Status Window
使用“状态”窗口可在操作运行期间或操作完成后查看启动、仪器校准、清洗或运行的状态。
Assay:仪器将要校准的检测的名称。
Status:状态,正在进行的操作的当前步骤。对于已完成的操作,显示上次操作的状态。
3、Tools Window
使用“工具”窗口指定数据导出设置、查看或添加孔板、运行软件IQ、运行诊断以及校准光学元件。
4、Views Window
使用“视图”窗口可以查看正在进行的运行或校准中已完成的样本孔的数据,或以前已完成的运行或校准。可以在GX Touch软件中查看数据并更改某些分析设置。
1)Egram/Gel Tab
在孔完成后,使用 EGram/Gel 选项卡查看分析孔数据的电泳图和凝胶。
2)EGram Tab
EGram选项卡是每个孔数据的可视化表示。
3)Gel Tab
四、样本检测
1、准备仪器以运行样本
1)打开LabChip GX Touch软件。
2)清洁电极和O形环。
3)吹扫压力管线。
4)如有必要,校准光学器件并运行诊断程序。
5)准备用于检测的芯片。
6)将芯片插入仪器。
7)对于蛋白质清除"HR芯片,校准仪器以运行蛋白清晰HR测定(见第26页)。
8)如有需要,在运行开始前对芯片进行预处理(不适用于Protein Clear HR芯片)。
9)为检测准备样品板、梯子和缓冲器。如果您的仪器配备了条形码阅读器,请“在板上放置条形码”以便在样品板上使用条形码。
10)如果需要,定义一个新的板类型,以使用软件中列出的板以外的板。
11)将样品板、梯子管和缓冲管装入仪器中。
2、运行检测
1)完成准备仪器以运行样品部分中的步骤。
2)定义分析运行的参数。
3)监控运行。
4)如果需要,请在运行期间编辑分析参数。
5)拆下平板、缓冲管和梯子管。
6)卸下芯片,根据分析用户指南中的说明存储芯片。
7)如有必要,在再次运行芯片之前立即清洗芯片。
3、数据分析
1)RNA分析
LabChip Touch平台提供了易于理解的RNA浓度以及核糖体RNA的比例,与RNA质量评分(RQS)共同用作完整性评价指标。
除RQS值外,分析软件现在可以自动计算DV200 值。
2)基因组DNA样品
为Labchip GX Touch系统开发的基因组DNA实验创新性的引入了基因组DNA质量评分(GQS)。
来源:科学小五说