摘要:我们刚刚提到UKB-PPP选择了Olink+Ultima作为蛋白组学+测序的供应商,Illumina成为了最大的输家。
我们刚刚提到UKB-PPP选择了Olink+Ultima作为蛋白组学+测序的供应商,Illumina成为了最大的输家。
但是,Illumina并未坐以待毙。
事情很快走到了第二赛季,还是加强版。
那么,发生了什么?Illumina值得如此“兴师动众”吗?
下面,咱们就来聊一聊争夺蛋白组学(非质谱)话语权的第二赛季。
#01
疾速反击
就在UKB宣布其UKB-PPP项目(The UK Biobank Pharma Proteomics Project)仅仅过去3天,Illumina就宣布反击。
2025年1月13日星期一,Illumina宣布与UKB和生物医药合作者们启动50,000(5万)例蛋白组学试点项目。
如果考虑到UKB-PPP项目的宣布是1月10日,也就是周五,那么这也仅仅过去1个工作日,可谓进展神速。
这不禁让我想起一位故人...虽然强敌环伺,Illumina还是有底蕴的。
本项目,参与者除了Illumina以外还包括deCODE Genetics、Standard BioTools、Tecan、GSK、JnJ和Novartis。
这里可以看到,药企的参与率并不高。
恐怕其中一个重要的原因就是为了提高效率,减少联盟沟通协调的时间所做出的妥协。
因此,在文中Illumina也留了一个口子:“ Illumina anticipates that additional companies will join the consortium.”
那么,钱是这些药企出么?样本又来自哪里?
非也。
这5万例样本中前3万例样本资金将全部来自Illumina、deCODE Genetics和Standard BioTools。
Tecan出自动化仪器,并不出钱(不知道耗材收不收钱)。
并且,这部分数据在2025年下半年完成后将立即分享给科研研究者(另外2万联盟内成员优先)。
“没有给我项目不要紧,我自己出钱还不行吗?”
Illumina为啥这么着急着反击呢?还自己贴钱?
#02
“打擂台”
如果仔细看就会发现,本次UKB提供的5万例样本同样来自UKB-PPP项目!
这很明显,Illumina是想用自家的产品与Olink+Ultima打擂台。
Illumina出测序仪、出试剂,Tecan出自动化、deCODE出管理协调和分析。
你别说,我脑子里只浮现出这4个字:合纵连横!
呃,等等,为啥Standard BioTools已经“嫁女”了也要出血?
一个可能是面对Olink的攻势,除了Illumina要证明自己的蛋白组学产品行以外,Standard BioTools也急需在同样的样品上打败(至少打平)Olink。
就算当年SomaLogic和Illumina的合作条款没有规定SomaScan要超越Olink,从未来竞争角度来考虑Standard BioTools这血也得出。
哦,对了,Illumina版本的SomaScan叫“Illumina Protein Prep(IPP,我随便缩写的)”。
看来Illumina对Prep这个词是真的很爱。
本次将使用Illumina Protein Pre+NovaSeq X Plus+DRAGEN Protein Quantification组成的Illumina“全家桶”,与Olink+Ultima进行全面对抗。
#03
“阳谋”
其实Illumian这招挺厉害的。
首先,时间上Illumina可能占优。
14家联盟出钱、协调都需要时间,而Illumina的联盟资金根本不是问题,而且参与者更少协调成本更低。
第二,争取科研圈好感。
3万例数据率先公开肯定能博得科研圈好感,激起科研圈使用IPP的兴趣。
众所周知,复读机是人类的本质,科研圈也一样。
第三,新技术beta测试。
虽然能检测6000种人类蛋白的IPP已经给合作伙伴早期测试了,然而IPP正式版本包括9000种蛋白检测能力显然也需要一个合适的展示舞台。
即便是只用6000的panel,也依然比Olink Explore HT的5000+多出20%。
你想想,如果科学家们被养刁了胃口,那以后会选谁呢?
当然,仅仅是针对Olink+Ulitma的反击还不够。
#04
“FPGA苦弱,GPU飞升”
众所周知,Illumina的DRAGEN平台用的FPGA(field-programmable gate array,现场可编程逻辑门阵列)方案。
该系统收购自Edico Genome,用于基因组分析显然没有任何问题。
只是,Illumina自己都可能没有想到,我们正在疾速进入A.I.时代。
Illumina自家的SpliceAI, PrimateAI-3D显然不太可能继续使用FGPA方案。
不说别的,你那玩意个客户,客户都不能玩黑神话...(划掉)
而A.I.目前的主流依然是GPU方案。
您猜怎么着?终于基因组学的巨头Illumina找上了皮衣男的Nvidia。
2025年1月13日,Illumina宣布与Nvidia达成合作协议,共同推动多组学、临床研究、A.I.应用和药物研发。
消息一出,Illumina开盘即暴涨超12%,随后收盘涨5.51%。
“FPGA苦弱,GPU飞升”啊。
#05
最后
这一波操作下来,Illumina也基本稳住了阵脚。
虽然Olink+Ultima阵营的实际威胁并不大,毕竟拿了60万大单了。
但是,他们的未来确实受到了不小的威胁。
如果IPP表现出惊人的性能,UKB-PPP项目是否会出现变数尚未可知。
不管怎么说,Olink+Ultima必然需要尽快公布第一批结果。
且不说是否在某些指标上是否领先IPP,先主打一个可靠稳定才是正事。
但,对于某些人来说:
“低成本复现UKB-PPP Nature爆文”
也许才是刚性需求吧....
来源:体外诊断网