Cell Death Differ | 非组蛋白乳酰化通过转录激活调控肝细胞癌进展机制

B站影视 2025-01-13 10:09 2

摘要:肝细胞癌(HCC)是一种高致命性恶性肿瘤,其5年生存率在中国仅为12.5%。临床上,许多患者在确诊时无法手术切除,且HCC易发生远处转移,治疗效果较差。靶向治疗是无法手术的HCC患者的重要治疗方法。因此,寻找新的有效治疗靶点对于改善HCC患者预后至关重要。

肝细胞癌(HCC)是一种高致命性恶性肿瘤,其5年生存率在中国仅为12.5%。临床上,许多患者在确诊时无法手术切除,且HCC易发生远处转移,治疗效果较差。靶向治疗是无法手术的HCC患者的重要治疗方法。因此,寻找新的有效治疗靶点对于改善HCC患者预后至关重要

近年来,代谢重编程在肿瘤发生发展中的作用逐渐受到关注。乳酸作为糖酵解的终产物,不仅为肿瘤细胞提供能量,还在肿瘤转移和治疗抵抗等过程发挥重要作用。此外,乳酸还可以作为底物介导发生乳酰化修饰,从而影响蛋白功能和生物过程。然而,乳酰化修饰在HCC中的进展机制仍有待进一步探究

1月3日,南京医科大学附属泰州人民医院袁寅/王宏刚团队安徽医科大学第一附属医院王强团队南京医科大学附属苏州医院敏晖团队联合在国际权威期刊Cell Death And Differentiation(IF=13.7)在线发表了题为“ABCF1-K430-Lactylation promotes HCC malignant progression via transcriptional activation of HIF1 signaling pathway”的研究成果,揭示了非组蛋白ABCF1(ATP-binding cassette subfamily F member 1)的430位赖氨酸,可以发生乳酰化修饰,并调控HCC进展及肺转移机制,为HCC治疗提供了潜在预后生物标志物和治疗靶点。景杰生物为该研究提供了多修饰抗体套装(PTM-6680,包含乳酰化、巴豆酰化、琥珀酰化等11种修饰泛抗体)及泛素化修饰抗体

此前,作者对3例正常肝组织,随访3年的非转移性HCC组织和转移到肺部的肿瘤组织,进行了乳酰化蛋白质组学研究。基于修饰差异分析,ABCF1与细胞呼吸和能量代谢的重要关联,及已有研究表明ABCF1在炎症、免疫和肿瘤中发挥重要作用,该研究聚焦于在HCC中显著高表达的ABCF1-K430la位点。作者通过乳酰化修饰抗体验证、点突变等方法证实其高表达与HCC预后不良、生长、转移相关。机制解析发现,ABCF1-K430la促使其入核,与KDM3A启动子结合,并激活KDM3A-H3K9me2-HIF1A轴,从而影响HCC进展及转移。

01 表型观察

ABCF1-K430la在HCC中异常高表达,并促进HCC生长和转移

研究首先通过免疫组织化学(IHC)检测发现ABCF1-K430la在HCC组织中显著表达,同时高表达组相较于低表达组更易发生肺转移,且总生存期较短,预后较差。而后研究团队通过点突变模拟乳酸化修饰(K430Q)和去乳酸化修饰(K430R),在体外和体内分别验证了ABCF1-K430la可促进HCC的生长和转移

图1 ABCF1-K430la在HCC中异常高表达,并促进HCC生长和转移

02 下游机制解析(1)

ABCF1-K430la通过HIF1A激活HIF1信号通路并促进乳酸的产生

为了确定ABCF1-K430la促进HCC生长和转移的下游机制,研究人员对对照组和K430Q的肝细胞癌细胞系(HepG2)进行了RNA-seq、KEGG通路分析,结果显著富集到HIF1信号通路。细胞实验发现抑制HIF1A(HIF1通路的关键因子)可以逆转ABCF1-K430la促癌作用,表明ABCF1-K430la通过激活HIF1信号通路发挥作用

HIF1A是重要的缺氧因子,可诱导癌细胞中乳酸脱氢酶(LDHA)的表达,并促进乳酸的产生。研究者推测ABCF1-K430la可能通过增强HCC中HIF1A的表达来促进乳酸的产生。通过检测不同细胞系(WT、K430R、K430Q)中乳酸和乳酸脱氢酶(LDH)含量发现,ABCF1-K430la 反过来可能会增加乳酸的产生,即HCC中存在乳酸-ABCF1 K430Kla-HIF1A-乳酸的闭环回路

图2 ABCF1-K430la通过HIF1A激活HIF1信号通路并促进乳酸的产生

03 下游机制解析(2)

ABCF1-K430la诱导ABCF1入核,并作为功能性转录因子调节KDM3A-H3K9me2-HIF1A轴

IHC结果发现ABCF1-K430la在HCC组织中主要定位于细胞核。系列动力学模拟实验结果表明ABCF1-K430la通过改变蛋白质结构,促进C端的NLS信号链NLS2的暴露,从而引导ABCF1入核

基于此,研究团队推测ABCF1-K430la可能作为转录因子发挥作用,ChIP-seq等实验结果表明ABCF1-K430la直接与KDM3A的启动子区结合。由于KDM3A是H3K9me2的经典去甲基化酶,研究进一步通过ChIP-seq等实验证实了ABCF1-K430la可以介导KDM3A-H3K9me2-HIF1A轴,并调控HIF1A的水平

图3 ABCF1-K430la通过KDM3A-H3K9me2-HIF1A轴在基因转录调控中发挥作用

04 乳酰化调控酶研究

P300、HDAC1/HDAC3分别是ABCF1乳酰化的“Writer”和“Eraser”

为鉴定参与ABCF1乳酰化的酶,研究通过IP-MS鉴定到p300、HDAC1、HDAC3和ABCF1的相互作用。而后使用shRNA敲低、抑制剂处理等实验,证实了P300是ABCF1乳酰化“Writer”HDAC1、HDAC3是ABCF1乳酰化“Eraser”。

05 药物筛选及临床验证

TubA通过靶向ABCF1-K430la有效抑制HCC的发展

为验证ABCF1-K430la作为肿瘤治疗靶点的潜力,研究团队分析了BCF1-K430la的蛋白质晶体结构,并通过小分子药物筛选及验证,锁定到微管糖苷A(HY-N2155,TubA)。而后通过系列实验证实了TubA主要靶向ABCF1的乳酰化,且可有效抑制了HCC细胞和类器官的生长

此外,小鼠模型也证实了证实了 TubA在体内的肿瘤抑制能力。以上结果表明ABCF1-K430la 可能是HCC靶向治疗的有效靶点。且抑制ABCF1-K430la的高效小分子化合物——TubA通过靶向ABCF1-K430la有效抑制HCC的发展

图4 微管糖苷A可特异性阻断ABCF1-K430la并抑制HCC生长和转移

综上所述,本研究明确了ABCF1-K430la的高表达与HCC进展、转移和患者预后相关,并揭示其调控HCC进展的作用机制:ABCF1的乳酰化诱导ABCF1进入细胞核,与KDM3A启动子结合以上调其表达,并激活KDM3A-H3K9me2-HIF1A轴,从而调控HCC进展及转移。此外,研究证实了TubA小分子化合物通过抑制ABCF1-K430la抑制HCC进展。为HCC的治疗提供了潜在治疗靶点和策略。

图5 本研究模式图

文章所用景杰抗体产品:

景杰评述

回看本文的研究思路,从表型观察出发,明确ABCF1-K430la参与HCC进展调控;而后通过IHC、ChIP-seq等实验进行机制解析,明确了ABCF1-K430la影响ABCF1蛋白入核,并通过激活KDM3A-H3K9me2-HIF1A轴影响HCC进展;进一步解析乳酰化过程的调控酶,明确了P300、HDAC1/HDAC3分别是ABCF1乳酰化的“Writer”和“Eraser”;最后筛选并临床验证了TubA小分子药物靶向ABCF1-K430la来治疗HCC肿瘤的潜力。这一整套流程环环相扣,值得我们参考借鉴。

值得一提的是,本研究是首次报道ABCF1在乳酰化后进入细胞核并作为HCC转录因子在基因转录调控中发挥作用的研究。也为未来乳酰化调控疾病进展的机制提供了新范式和研究案例。

景杰生物作为乳酰化修饰研究的领跑者,可提供“从WB预筛选,乳酰化修饰组学分析,到运用丰富的乳酰化位点特异性抗体进行功能验证,再到后续的CUT&Tag分析”等全流程服务。景杰生物PTMab抗体产品具有高特异性、高亲和力、高批间一致性等优势,其应用也多次见刊于Cell, Nature, Science等国际顶尖杂志。如果您想了解景杰生物研究产品和服务的更多信息,可咨询景杰生物销售工程师、或拨打科服热线400-100-1145。


参考文献:

Hong H, et al. 2025. ABCF1-K430-Lactylation promotes HCC malignant progression via transcriptional activation of HIF1 signaling pathway. Cell Death Differ.

来源:景杰生物

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