摘要：大家好，欢迎观看《时空日报》第379期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的Genpilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
大家好，欢迎观看《时空日报》第379期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的Genpilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
1、对免疫热肿瘤和免疫冷肿瘤进行单细胞及空间分析，鉴定出与不同免疫微环境相关的成纤维细胞亚型及积极免疫治疗应答
Single cell and spatial analysis of immune-hot and immune-cold tumours identifies fibroblast subtypes associated with distinct immunological niches and positive immunotherapy response
Mol Cancer; IF:27.700; DOI: 10.1186/s12943-024-02191-9
内容概要：
① 科研人员对癌症相关成纤维细胞（CAFs）进行了深入研究，发现这些细胞在抗肿瘤免疫中发挥着关键作用。然而，关于CAFs的有益和有害特性，目前仍缺乏充分的了解。为了更深入地探究CAFs的功能，科研人员采用了单细胞和空间转录组分析技术，对比了头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的不同亚组。这些亚组虽然具有异质性，但大体上可以分为免疫热型和免疫冷型，分别对应于HPV阳性和HPV阴性肿瘤。这一分析揭示了CAFs在HNSCC中的多样性和复杂性。
② 在分析过程中这项研究确定了六种成纤维细胞亚群，其中包括两种具有免疫调节基因表达谱的亚群：IL-11+炎症相关成纤维细胞（iCAF）和CCL19+成纤维网状细胞样细胞（FRC样细胞）。IL-11+ iCAF在空间上与炎症单核细胞相关联，并可通过IL-1β和TNF-α对经典NF-κB信号通路的协同激活在体外进行调节。另一方面，FRC样细胞在免疫热HPV阳性肿瘤中更为丰富，它们与三级淋巴结构中的CD4+ T细胞和B细胞密切相关，并通过淋巴毒素激活非经典NF-κB信号通路来发挥其作用。这些发现为理解CAFs在HNSCC中的免疫调节作用提供了新的视角。
③ 此外，科研人员还进行了泛癌分析，以探究CAFs在不同类型癌症中的普遍性和特异性。结果显示，在正常和癌症组织中均存在几种“iCAF”亚群。特别地，在胃肠道（GI）肿瘤中发现了IL11+ iCAF，这些细胞与先前在胰腺癌和乳腺癌中描述的iCAF在转录组上存在显著差异，并表现出更强的炎症特性。同时，FRC样成纤维细胞在所有肿瘤类型中的频率均较低，但与接受检查点免疫治疗的患者的显著更佳生存期相关。这些发现不仅进一步阐明了CAFs的免疫调节功能，还强调了CAFs与重要免疫微环境之间的联系，为癌症免疫治疗提供了新的潜在靶点。
疾病研究： 癌症相关成纤维细胞（CAFs）,抗肿瘤免疫,头颈鳞状细胞癌（HNSCC）,成纤维细胞亚群,免疫调节,泛癌分析,生存期，scRNA-seq; Jenkins BH, Tracy I, Rodrigues M, et al.; School of Cancer Sciences, University of Southampton, Southampton, UK.
2、多模态转录组学揭示齿状回神经发生衰老轨迹及年龄相关性局部炎症
Multimodal transcriptomics reveal neurogenic aging trajectories and age-related regional inflammation in the dentate gyrus
Nat Neurosci; IF: 21.200; DOI: 10.1038/s41593-024-01848-4
内容概要：
① 哺乳动物的齿状回（DG）在大脑中扮演着重要角色，它参与特定的学习和记忆过程。然而，研究表明DG的功能障碍与多种年龄相关疾病有关联。在DG中，神经干细胞（NSCs）具有持续生成新神经元的能力，这使得DG在整个生命过程中都保持着神经发生的潜力。但值得注意的是，随着年龄的增长，DG中的神经发生逐渐减少，这可能与年龄相关的认知衰退和疾病风险增加有关。
② 为了更深入地了解DG神经发生的衰老机制，研究者们采用了scRNA-seq技术。他们成功描绘了神经发生细胞及其周围DG微环境的转录组特征，并鉴定出从静息态神经干细胞激活到命运决定后代成熟过程中与神经发生衰老相关的分子变化。这一发现不仅为我们提供了对DG神经发生衰老过程的深入理解，还为后续研究提供了宝贵的分子标记和潜在的干预靶点。
③ 此外，研究者们还整合了空间转录组数据，进一步揭示了炎性细胞在衰老过程中对海马体，特别是DG区域的区域性侵入的现象。他们发现，早期发生的神经炎症会降低神经发生活性，这进一步证实了神经炎症与神经发生衰老之间的密切联系。综上所述，这些研究数据不仅揭示了神经干细胞及其周围神经发生的DG微环境在衰老过程中的分子动态变化，还为理解衰老海马体中与年龄相关的分子改变提供了有力的资源，有助于我们更好地认识和治疗与年龄相关的认知衰退和疾病。
疾病研究：哺乳动物,齿状回（DG）,年龄相关疾病,神经干细胞（NSCs）,神经发生衰老 ,炎性细胞,海马体,神经炎症,空间转录组，scRNA-seq；Wu Y, Korobeynyk VI, Zamboni M, et al.; Laboratory of Neural Plasticity, Faculties of Medicine and Science, Brain Research Institute, University of Zurich, Zurich, Switzerland.
来源：科学百态圈
