摘要：近日，莫斯科临床科学中心、莫斯科高级研究中心和俄罗斯联邦创新研究中心的科学家们在International Journal of Molecular Sciences上发表了题为“Pancreatic Neuroendocrine Tumor: The Cas

文章梗概

近日，莫斯科临床科学中心、莫斯科高级研究中心和俄罗斯联邦创新研究中心的科学家们在International Journal of Molecular Sciences上发表了题为“Pancreatic Neuroendocrine Tumor: The Case Report of a Patient with GermlineFANCD2Mutation and Tumor Analysis Using Single-Cell RNA Sequencing”的研究成果。该研究基于真迈生物SURFSeq 5000测序平台，对1例非功能性胰腺神经内分泌肿瘤患者，进行了全外显子和单细胞转录组测序与分析。研究者确认了胚系突变FANCD2的存在，并检测到新的胚系突变WNT10A。而单细胞测序识别了主要的细胞簇，包括肿瘤相关的细胞簇。基于此，患者接受了外科治疗。

背景介绍

胰腺神经内分泌肿瘤（Pancreatic Neuroendocrine Tumor，PanNENs）是一类起源于神经内分泌细胞的罕见肿瘤，占所有胰腺肿瘤的1-2%。根据激素分泌情况，PanNENs分为功能性和非功能性两类。非功能性PanNETs约占60-90%。这些肿瘤进一步被分类为分化良好的神经内分泌瘤（NETs）和分化差的神经内分泌癌（NECs）。近年来，随着高精尖影像技术的应用，小尺寸（≤2cm）非功能性PanNETs的检出率有所提高。尽管如此，这些肿瘤的预后和进展缺乏特异性标志物。本研究关注携带胚系FANCD2突变的PanNET患者，探讨其临床特征和肿瘤基因组学。

*以下为该研究成果解读

案例报道

患者D，女性，66岁，自2021年12月以来感到上腹部不适。在当地门诊进行检查时，通过胃镜发现了糜烂性胃炎。后被诊断为胰腺体部的非功能性神经内分泌肿瘤（NETs）。诊断的合并症包括1级、1期动脉高血压、慢性浅表性胃炎和食管裂孔疝。肿瘤在组织学上呈现小梁状和类腺样（假腺体）结构。收集的肿瘤组织样本的一部分用于制备单细胞悬液，完成5′ 10× Genomics的单细胞RNA测序（scRNA-seq）。为了进一步评估胚系FANCD2和WNT10A突变对肿瘤的影响，对患者的肿瘤样本进行了全外显子组测序（WES）。

为了更精确地定义肿瘤微环境的细胞组成模式，研究者将已发表的四个PanNET样本的scRNA-seq数据与本案例做了整合（图2A）。在完成批次校正后，合并的细胞群包含了来自不同样本的细胞（图2B）。研究者基于已知的marker基因，绘制了各个细胞亚群中表达量的分布图（图2C）。通过整合已发表的数据，研究者将T细胞和NK细胞细分为CD4+ T细胞、CD8+ T细胞和NK细胞，并识别了内皮细胞/成纤维细胞群体，尽管这些细胞在患者样本中并未被检测到（图2D）。

总体而言，研究发现所有样本中不同细胞类型的比例相似。然而，由于实验设计中存在CD45阳性细胞富集步骤，这使得已发表的scRNA-seq数据中肿瘤的基质细胞比例相对较高。为明确FANCD2和WNT10A这两个基因的胚系突变与临床表型之间的关联，例如它们对治疗的反应和预后的影响，以及肿瘤分子水平的变化，需要收集一组携带这些基因变异的患者样本。目前，关于PanNETs的已发表数据量有限，这限制了更复杂的分析；不过，本研究提供的scRNA-seq数据和肿瘤样本的基本特征分析结果，将有效促进未来研究的发展。

患者的肿瘤突变负担（TMB）为2.05次突变/Mb。虽然这个速率通常被认为是低TMB，但对于PanNET而言，这一数值相对较高，因为PanNET的平均TMB为0.82（0.04–4.56）突变/Mb或更低。这种较高的TMB这可能与FANCD2突变导致的DNA修复功能受损有关。此外，通过对样本的突变谱进行COSMIC突变特征分析，发现存在与碱基切除修复缺陷相关的SBS30特征（图3B）。目前，已知FANCD2被证明与DNA交联修复相关，而在PanNET中，FANCD2的损伤可能对碱基切除修复机制（BER）的影响更为显著。值得注意的是，该肿瘤还表现出MUTYH的缺失（4个拷贝中有2个缺失）。此前有研究指出，MUTYH的缺失与BER缺陷相关，这可能是观察到BER缺陷特征存在的另一种解释。

结论

基因FANCD2在肿瘤中的作用可能是双重的，既与多种肿瘤的发生有关，又在某些情况下与肿瘤的不良预后相关。本病例中，FANCD2突变可能促进了肿瘤的发展和侵袭性，提示针对FANCD2突变的PanNET患者，个性化治疗策略的选择可能需要考虑这一基因变异。此外，FANCD2突变的存在可能使患者对PARP抑制剂治疗敏感，为未来治疗提供了新方向。

参考文献

Avsievich E, Salimgereeva D, Maluchenko A, et al. Pancreatic Neuroendocrine Tumor: The Case Report of a Patient with Germline FANCD2 Mutation and Tumor Analysis Using Single-Cell RNA Sequencing[J]. Journal of Clinical Medicine, 2024, 13(24): 7621.

来源：新浪财经