摘要:结构优化的核心目标是通过调整原子位置或晶格参数,使体系的总能量达到最小值。在VASP中,这一过程通常通过迭代算法实现,例如共轭梯度法(Conjugate Gradient)或准牛顿法(Quasi-Newton)。优化过程中,系统会根据当前的原子力和能量变化进行
VASP结构优化原理
结构优化的核心目标是通过调整原子位置或晶格参数,使体系的总能量达到最小值。在VASP中,这一过程通常通过迭代算法实现,例如共轭梯度法(Conjugate Gradient)或准牛顿法(Quasi-Newton)。优化过程中,系统会根据当前的原子力和能量变化进行调整,直到满足预设的收敛条件(如能量变化小于设定值)。
结构优化的理论基础是密度泛函理论(DFT),其核心是通过交换-相关泛函(如GGA或LSDA)来描述电子结构。在VASP中,常用的交换-相关泛函包括Perdew-Wang 1991(PW91)和PBE等。这些泛函通过近似描述电子之间的相互作用,从而计算体系的总能量和结构。
准备工作
VASP计算需要准备超算连接软件EASYCONNECT与SSH,建模软件VESTA,以及VASP的输入文件INCAR,KPOINTS,POTCAR
VESTA软件下载链接
EASYCONNCT软件下载链接
EasyConnect下载-EasyConnect最新版下载V7.6.7.0
Winscp软件下载链接
Downloading WinSCP-6.5.3-Setup.exe :: WinSCP
VASP输入参数
INCAR文件:
ISTART=0 #开始新的任务,随机产生初始波函数
ICHARG=2 #开始新的任务,从原子电荷密度产生体系初始电荷密度
PREC=M #计算精度,决定ENCUT
ISPIN=2 #打开自旋极化
ALGO=N #确定电子优化的算法
NELM=60 #电子波函数最多计算60步
EDIFF=1E-5 #相邻两步电子迭代的能量差收敛标准
ENCUT=400 #平面波截断能400 eV
IVDW=11 #考虑范德华力修正
IBRION=2 #共轭梯度算法,适用于结构优化
NSW=100 #离子弛豫的步数
ISIF=2 #固定晶格优化原子坐标
EDIFFG=-0.1 #离子弛豫的force的收敛标准
ISMEAR=0 #费米能级附近电子占据数为高斯分布,适合金属、半导体、绝缘体
SIGMA=0.1 #高斯分布展宽0.1 eV
KPOINTS文件:
Automatic generation #注释行
0 #自动产生K点网格
G #布里渊区K点网格以Gamma点为中心
1 1 1 #K点网格密度
0 0 0 #K点网格中心平移矢量
构建H2分子模型
第一步,构建超胞模型并优化结构
用文本编辑器创建h2.vasp文件,并写入晶格常数15
第二步,写入H原子个数2与坐标类型Cartesian
第三步,写入H原子坐标,键长0.74 A
第四步,用VESTA软件打开h2.vasp文件确认结构
总结
今天华算科技朱老师给大家介绍氢气分子的模型构建,氢气分子一共就两个原子,那这里可以手动来构建这个模型,先新建一个POSCAR 文件,比如叫 h2.vasp,接下来慢慢的写入相应的结构信息。对于POSCAR 来说第一行是注释,比如就写一个h2,然后是晶胞的放大倍数,这里不放大用1.0。对于孤立分子,这个晶胞一般选择的是立方晶胞,而且是一个比较大的,选择晶格常数是 15 的,晶格已经做好了,接下来是原子个数,那我们是氢原子两个坐标类型,一般选择笛卡尔坐标。
再是两个原子的具体的坐标数值,把它放在模型靠中间一点的位置,这是第一个氢原子,那么第二个氢原子可以沿着任何方向延长,这个相应的键长就可以,比如沿 z 方向延长 0.74A,正好是氢气的键长,这样子就把模型构建好了,用 VESTA 来检验一下。把键连一下,可以看到这个就是氢气分子长度是 0.74A。
来源:朱老师讲VASP
