摘要:接上篇,目前很多同学仅使用其基础统计功能(如 t 检验、ANOVA),而忽略了其高级统计模型(如非线性回归、生存分析、多变量分析等)。本篇将详细介绍如何在 GraphPad Prism 中应用不同的高级统计模型,包括:
图片来源:小编自己的
接上篇,目前很多同学仅使用其基础统计功能(如 t 检验、ANOVA),而忽略了其高级统计模型(如非线性回归、生存分析、多变量分析等)。本篇将详细介绍如何在 GraphPad Prism 中应用不同的高级统计模型,包括:
非线性回归(Nonlinear Regression)
生存分析(Survival Analysis)
多变量分析(Multivariate Analysis)
混合效应模型(Mixed Effects Models)
主成分分析(PCA)
快来学!
1
非线性回归(Nonlinear Regression)
适用场景:拟合剂量-反应曲线、酶动力学(Michaelis-Menten)、生长曲线(Gompertz)、受体结合(Sigmoidal dose-response)等。
Step 1:输入数据:
在数据表中输入 X(如药物浓度)和 Y(如反应值)。
Step 2:选择模型:
点击Analyze → Nonlinear regression (curve fit)
从预设模型中选择(如「Dose-response - Inhibition」或「Kinetics - Michaelis-Menten」)或自定义方程(User-defined equation)
Step 3:调整参数:
根据研究目的增加 IC50 或 EC50 的设置
2
生存分析(Survival Analysis)
适用场景:比较两组或多组的生存曲线(如临床试验中的生存率、动物实验中的存活时间)。
Step 1:输入数据:
列 1:时间(如天数)
列 2:事件(1 = 死亡/事件发生,0 = 删失)
分组列(如对照组 vs 处理组)
Step 2:选择分析:
Analyze → Survival analyses → Survival curve
Step 3:设置参数:
选择比较方法(Log-rank test、Gehan-Breslow-Wilcoxon test)
Step 4:
根据分析结果标注相关参数:
Hazard Ratio(HR)(风险比)
P 值(组间差异显著性)
3
多变量分析(Multivariate Analysis)
适用场景:分析多个变量对结果的影响(如多元线性回归、逻辑回归)。
Step 1:输入数据:
因变量(X)
多个自变量(Y1, Y2, ...)
Step 2:选择分析:
Analyze → Multiple regression(线性回归)
或Analyze → Logistic regression(逻辑回归)
Step 3:
根据研究需要设置参数,选择相应的图表:
4
混合效应模型(Mixed Effects Models)
适用场景:重复测量数据、嵌套数据(如不同时间点的测量、同一患者的多次观测)。
Step 1: 输入数据:
点击Graphs → New Graph →选择「Grouped」或「XY」图
X轴:时间(Time)或分组变量(Treatment)。
Y 轴:因变量(Response)。
Step 2:选择分析:
1
打开数据表,点击Analyze → Mixed Models → Mixed Effects Model。
2
选择因变量(Response)和固定效应(Fixed Effects,如 Treatment、Time)。
3
指定随机效应(Random Effects,如Subject ID)。
Step 3:设置参数:
定义固定效应和随机效应
选择协方差结构(如 AR1、Compound Symmetry)
5
主成分分析(PCA)
适用场景:降维、识别数据模式(如基因表达、代谢组学数据)。
Step 1:输入数据:
Step 2:选择分析:
Analyze → Principal Component Analysis (PCA)
Step 3:设置参数:
Options 中设置数据的标准化方法和主成分选择方法。这里标准化方法默认为 Z-score 标准化
下期预告:
将从宏录制、脚本编写到批量处理,手把手教你成为 GraphPad 高效能用户。
关于 GraphPad 的使用操作,还有哪些想要了解的,可以留言,我来写~你来学~
题图来源:自制
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来源:小雨科技频道