摘要:质谱检测在蛋白定量测定中是一种强大的技术,能够提供高通量、高灵敏度和高精度的蛋白质表达水平信息。以下是使用质谱进行蛋白定量测定的基本流程:
质谱检测在蛋白定量测定中是一种强大的技术,能够提供高通量、高灵敏度和高精度的蛋白质表达水平信息。以下是使用质谱进行蛋白定量测定的基本流程:
1、样本准备:· 蛋白质提取:从生物样本中提取蛋白质,通常涉及细胞裂解、组织匀浆等步骤。
· 蛋白质纯化:通过离心、过滤等方法去除非蛋白质成分。
· 蛋白质量化:使用Bradford、BCA等方法确定蛋白质浓度。
2、蛋白质消化:
酶解:将蛋白质样品用酶(通常是胰蛋白酶)处理,将蛋白质分解成较小的肽段。
3、肽段的定量标记(可选):· 标记定量:如同位素编码的绝对和相对定量(iTRAQ)、稳定同位素标记的氨基酸在细胞培养中(SILAC)等,通过化学标记或同位素标记技术对肽段进行定量标记。
· 非标记定量:也可以直接进行非标记定量分析,如标签自由定量。
4、液相色谱(LC)分离:
肽段分离:使用液相色谱(LC)技术对肽段进行分离,以减少样本复杂性并提高质谱检测的效率和灵敏度。
5、质谱(MS)分析:
MS检测:经过LC分离的肽段被送入质谱仪进行检测,质谱仪根据肽段的质荷比(m/z)和碎片模式进行鉴定和定量。
6、数据分析:· 蛋白质鉴定与定量:使用专门的软件和数据库对质谱数据进行处理,鉴定肽段和蛋白质,并进行定量分析。
· 生物信息学分析:进一步分析蛋白质的功能、相互作用网络和生物学通路。
7、结果验证(可选):
独立验证:使用西方印迹(Western blot)、酶联免疫吸附测定(ELISA)等技术对质谱结果进行验证。
来源:科学探秘大学堂