复旦大学发表最新Cell论文

摘要：2025 年 8 月 26 日，复旦大学公共卫生学院粟硕团队（Yuqi Shi、Yuxing Li等人为共同第一作者）在国际顶尖学术期刊Cell上发表了题为：Extensive cross-species transmission of pathogens a

撰文丨王聪

编辑丨王多鱼

排版丨水成文

当前的病原体监测体系聚焦家畜（猪、牛、羊等养殖动物）与伴侣动物（猫、狗等宠物），但非传统养殖（皮毛动物、实验动物等）和野生哺乳动物的病原交互未受重视。

2025 年 8 月 26 日，复旦大学公共卫生学院粟硕团队（Yuqi Shi、Yuxing Li等人为共同第一作者）在国际顶尖学术期刊Cell上发表了题为：Extensive cross-species transmission of pathogens and antibiotic resistance genes in mammals neglected by public health surveillance 的研究论文。

该研究在看似健康的无症状哺乳动物（含养殖与野生哺乳动物）中检测到大量未被记录的病毒和细菌，并揭示了其中广泛的跨物种传播，还在养殖和野生哺乳动物的微生物组中发现了多种与人类共享的可移动的抗生素抗性基因。这些发现凸显了公共卫生监测中忽视了哺乳动物中病原体和抗生素抗性基因的广泛跨物种传播。

在这项最新研究中，研究团队通过对 973 只无症状哺乳动物的粪便和组织样本进行宏基因组和宏转录组测序，从中鉴定出128 种病毒（其中 30 种为新发现病毒），包括一个新的冠状病毒属；10255 种细菌（超过 7000 种未被描述过），201 种真菌和7 种寄生虫。

养殖和野生哺乳动物共存有 13.3% 的病毒种类，其中包括在亚洲黑熊体内发现的犬冠状病毒（canine coronavirus）以及在兔子体内发现的盖塔病毒（Getah virus），而 H5N1 禽流感病毒的 2.3.4.4b 分支则在一只野生豹猫体内被发现。该研究还发现，养殖哺乳动物与野生哺乳动物之间存在潜在的细菌病原体传播，还发现了与人类体内发现的细菌菌株具有高度遗传相似性的菌株。

研究团队还在养殖和野生哺乳动物的微生物组中观察到 157 种临床重点关注的抗生素抗性基因（antibiotic resistance genes，ARG），其与人类微生物组中的 ARG 的同源性超过 99%，且常常与可移动遗传元件（MGE）共同出现。

该研究的核心发现：

在 973 种非传统哺乳动物体内发现了 7063 种未描述过的细菌和一个新的冠状病毒属；

在 4 种不同的哺乳动物体内发现了高度多样化的甲型流感病毒；

细菌，包括病原体，在不同地区、宿主类别和生活方式之间都有共享；

养殖和野生哺乳动物与人类共享的可移动的抗生素抗性基因。