兰州大学研究团队绘制出国际首张绵羊多组织表观遗传调控图谱

B站影视 2024-12-19 10:58 2

摘要:12月15日,兰州大学王维民教授团队在国际期刊《iMeta》上在线发表了题为“Comprehensive multi-tissue epigenome atlas in sheep:A resource for complex traits, domestic

12月15日,兰州大学王维民教授团队在国际期刊《iMeta》上在线发表了题为“Comprehensive multi-tissue epigenome atlas in sheep:A resource for complex traits, domestication and breeding”的重要研究成果。该研究基于绵羊9个重要组织的多维度(RNA-Seq、ATAC-Seq、CUT&Tag和Hi-C)数据,绘制出国际首张绵羊多组织表观遗传调控图谱,对绵羊基因组进行了系统功能注释,鉴定出753,723个非冗余功能元件,其中60%以上为首次发现,主要包括与感知能力、免疫反应和尾部脂肪沉积相关的组织特异性启动子和增强子(图1);并结合全球不同尾型的绵羊品种和通过10年积累构建出的“两千级”规模的羊群列队,首次在绵羊上采用“表型组-基因组-表观组-3D基因组”的多维整合组学策略鉴定出影响绵羊尾脂沉积的关键基因(BMP2)及新的因果变异(Chr13:51760995 A > C)(图2)。填补了绵羊这一物种在多组织表观遗传调控图谱领域的空白,为绵羊育种提供了宝贵的数据资源和基因素材。

图1 绵羊多组织表观遗传调控图谱的设计与绘制

图2 整合表型组-基因组-表观组-3D基因组学数据鉴定绵羊尾脂沉积的因果变异

兰州大学草地农业科技学院王维民教授为通讯作者,博士研究生张德印、程江博和李晓龙为共同第一作者,李发弟教授为该工作提供了重要指导意见,兰州大学乐祥鹏教授、李万宏教授、田慧彬副教授、翁秀秀高级实验师,甘肃农业大学汪晓娟教授、唐德富教授、年芳教授、郑琛教授、李冲副教授、张小雪副教授,上海海洋大学胡鹏教授,崖州湾国家实验室主任科学家赵云霞、博士后Peter Kalds,美国华盛顿州立大学姜志华教授和宾夕法尼亚大学冯园庆教授等为该研究做出重要贡献。该研究受到国家重点研发计划青年科学家项目(2022YFD1302000)、国家重点研发计划(2021YFD1300901、2023YFF1001000)、国家自然科学基金(32372850、32260818)、甘肃省科技重大专项(22ZD6NC069)和新疆维吾尔自治区天池人才引进计划等项目的资助。

来源:爱喝奶茶的科学家

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