摘要:本研究采用系统药理学方法筛选杜仲活性成分与IDD疾病靶点,通过GEO数据差异分析、GO/KEGG富集、分子网络构建锁定核心成分山奈酚,并利用IL-1β诱导的人髓核细胞模型,从细胞活力、衰老、氧化应激、凋亡、细胞外基质代谢及MAPK信号通路等方面进行系统验证。
题目:
Network Pharmacology and Experimental Validation Identify Kaempferol as a Key Anti-IDD Compound from Eucommia ulmoides Oliver
研究思路梳理:
本研究采用系统药理学方法筛选杜仲活性成分与IDD疾病靶点,通过GEO数据差异分析、GO/KEGG富集、分子网络构建锁定核心成分山奈酚,并利用IL-1β诱导的人髓核细胞模型,从细胞活力、衰老、氧化应激、凋亡、细胞外基质代谢及MAPK信号通路等方面进行系统验证。
主要结果:
1. 活性成分与疾病靶点筛选
从TCMSP数据库中筛选出8个符合OB ≥ 30%、DL ≥ 0.2的杜仲活性成分,共对应4151个药物靶点。通过GeneCards获取879个IDD疾病靶点,结合GSE34095数据集筛选230个差异表达基因,最终交叉得到13个重叠核心基因(如FN1、MMP2、COL3A1等)。
2. 功能富集与网络构建
GO/KEGG分析显示,核心基因显著富集于AGE-RAGE信号通路、癌症蛋白聚糖、MAPK/ERK/PI3K-Akt信号通路、骨骼系统发育等关键过程。进一步构建“成分—靶点—通路”网络,明确山奈酚为最具潜力的核心成分。
3. 山奈酚改善IL-1β诱导的人类髓核细胞功能异常
在IL-1β诱导的IDD细胞模型中,山奈酚(10 μM)可显著:①提升细胞活力,抑制细胞衰老(SA-β-gal阳性率下降);②降低ROS水平,增强抗氧化基因(Nrf2、HO-1、SOD1/2)表达;③抑制细胞凋亡,调节Bax/Bcl-2与Cleaved-caspase 3水平。
来源:TCMSP系统药理学