摘要:Vienna Ab initio Simulation Package (VASP) 是一个计算机程序,用于从第一性原理进行原子尺度材料建模,例如电子结构计算和量子力学分子动力学。
Vienna Ab initio Simulation Package (VASP) 是一个计算机程序,用于从第一性原理进行原子尺度材料建模,例如电子结构计算和量子力学分子动力学。
在 VASP 中进行分子动力学模拟时,不需要提供力场参数,只需提供原子的初始结构即可。VASP 将通过电子波函数的正交化求解原子受力,进而求解牛顿运动方程,从而模拟原子的运动轨迹。
本次教程将演示 NVT 系综下的分子动力学,通过本教程,您将了解 VASP 分子动力学的核心命令 tag:以 NVT 为例。
MDALGO = 2
SMASS = -1
用户可根据需要修改 tag,以实现其他不同系综的分子动力学模拟。
教程链接:https://go.openbayes.com/aARaP
使用云平台:OpenBayes
https://openbayes.com/console/signup?r=Dennis9801_1ohB
本教程将使用 INCAR、POSCAR、KPOINTS 和 POTCAR 作为输入文件。
为了简化计算,本次只采用 8 个原子的小超胞。
为了减少计算资源,只选了 2x2x2 的 k 网格点。
系统对应元素的赝势组合,这里为 Si 的赝势。
页面跳转后,点击右上角「克隆」,将该教程克隆至自己的容器中。
选择「NVIDIA GeForce RTX 4090」以及「vasp」镜像,OpenBayes 平台提供了 4 种计费方式,大家可以按照需求选择「按量付费」或「包日/周/月」,点击「继续执行」。可以使用文章开头的邀请链接,获得 RTX 4090 使用时长!
待系统分配好资源,当状态变为「运行中」后,点击「打开工作空间」。
上传准备好的硅赝势,本教程已将其他文件准备完毕。此处可以使用官网示例里的赝势 POTCAR 文件,将文件放到目录中。
待 vasp 运行完毕后,即可下载原子轨迹文件。
用 ovito 打开导出动图。
来源:易玲珑的世界