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Cell丨活细胞内直接接触DNA的蛋白质动态图谱

在真核细胞中，DNA与蛋白质的相互作用构成了基因组功能调控的核心基础。DNA并非以裸露的线性分子形式存在，而是与组蛋白、RNA以及大量染色质相关蛋白共同构成高度组织化的三维空间结构。这种复杂的核内环境使得只有特定蛋白质能够在特定时间点直接接触DNA，参与调控基

染色质的空间组织结构是维持基因组稳定性、实现基因表达精准调控关键环节。在植物中，已有诸多参与调控关键农艺性状的远程调控元件被鉴定。然而，现有三维染色质构象捕获技术（如Hi-C, ChIA-PET, HiChiP和OCEAN-C等）仍难以在低成本条件下无偏好性地

编码转录因子 c-Myc 的 MYC 基因是最为常见的异常激活的原癌基因之一，其基因扩增发生在超过 50%的人类癌症中。传统观点认为MYC 蛋白通过结合启动子区域 DNA 以调控下游靶基因的转录。近年来的研究表明，部分

这种方法是最基础的免疫沉淀技术，通常使用抗体与蛋白A/G珠子结合的形式。该方法的优点在于操作简便，适用于大多数实验室环境。但需要注意的是，选择合适的抗体和珠子是成功的关键。

为解决 3D 基因组染色质拓扑结构调控因子研究受限，缺乏高效筛选技术的问题，研究人员开展了名为 Perturb-tracing 的技术研究。他们发现众多新调控因子，研究成果发表在《Nature Methods》上明确其多尺度作用及与已知机制关联，还揭示染色质压

基因组的三维空间结构调控是近年来分子生物学领域的重要研究方向。在两侧对称动物（如脊椎动物和昆虫）中，大量研究表明染色质环（chromatin loops）在基因表达调控中发挥着核心作用。这种三维结构通过将基因组上相距遥远的调控元件（如增强子）与目标基因的启动子

我们身体里形态和功能千差万别的细胞，从思考的大脑神经元到跳动的心脏肌肉细胞，都携带着同一套DNA密码本？如果基因组序列是生命的蓝图，那究竟是什么力量决定了每个细胞会“阅读”和执行蓝图中的哪些部分，最终构建出如此多姿多彩的生命？答案不仅藏在DNA的线性序列里，更