摘要：原文作者：Amandine Sury , Margo Maex , Alain Baulard , Roby P Bhattacharyya, Stéphanie Depickère, Deborah T Hung, Paul Cos, Fadel Sayes

利用RNA生物标志物加速结核分枝杆菌的药物敏感性测试

原文题目：Speeding up drug susceptibility testing in Mycobacterium tuberculosis using RNA biomarkers

原文作者：Amandine Sury , Margo Maex , Alain Baulard , Roby P Bhattacharyya, Stéphanie Depickère, Deborah T Hung, Paul Cos, Fadel Sayes, Wafa Frigui, Roland Brosch, Vanessa Mathys, Elizabeth M Streicher, Frederik De Keersmaeker, Leen Rigouts, Pieter-Jan Ceyssens, An Van den Bossche

背景

耐药结核病的有效管理依赖于快速诊断。为了加速结核分枝杆菌（TB）的表型药物敏感性试验 （pDST），本文探讨了TRACeR-TB：一种通过抗结核药物耐药 特异性mRNA生物标志物推断耐药性的测试方法。

方法

本研究建立了抗结核药物的TRACeR-TB体系。 通过对四种抗结核药物暴露的敏感菌株进行RNA测序实验，确定了耐药性目标基因， 设计药物特异性多重Quanti-gene，用于直接从粗提的细菌 裂解液中量化每种药物的8-9个生物标志物的mRNA水平。通过将238株具有不同耐药性特征的菌株同时进行TRACeR-TB和分枝杆菌生长指示管（MGIT）pDST测试作为参考标准，比较TRACeR-TB检测性能。此外，本研究 探索了TRACeR-TB在评估增强抗生素疗效的分子中的潜力，并研究了其在巨噬细胞模型中的应用，以评估结核分枝杆菌对药物的细胞内应激反应。

结果

抗结核药物在敏感但非耐药的杆菌中触发了独特的转录应激反应，仅在与药作用6小时内，即可区分敏感和耐药的表型 。对238株菌株检测结果 显示，TRACeR-TB的敏感性为100%（95% CI: 93.1-100%），特异性为89.5%（95% CI: 74.7-97.2%），而MGIT pDST的敏感性为82.3%（95% CI: 69.2%-91.5%），特异性为94.8%（95% CI: 81.9%-99.4%）。TRACeR-TB的特异性可能被低估，结果 包含携带未表征突变的分离株。对于MGIT 方法pDST结果可靠的药物（莫西沙星和异烟肼），TRACeR-TB与MGIT pDST结果的一致性为100%。此外，其敏感性优于目前利福平pDST结果，前者 检测到了MGIT遗漏的所有临界耐药菌株的耐药性，以及贝达喹啉测试。此外，该检测方法还检测到了新型药物增强剂的预期效果以及巨噬细胞模型中的细胞内药物诱导应激，突显了其在药物优化中的潜力。

来源：京津冀消息通