Cell重磅:AI从头设计生成小型结合蛋白,大幅提高先导编辑效率

B站影视 电影资讯 2025-08-06 15:33 2

摘要:原创 生物世界 生物世界 中国香港撰文丨王聪编辑丨王多鱼排版丨水成文自 CRISPR-Cas9 基因组编辑技术问世以来,人们为拓展其应用范围付出了大量努力,从而开发出了碱基编辑器(Base editor,BE)和先导编辑器(Prime editor,PE)。碱

原创 生物世界 生物世界 中国香港撰文丨王聪编辑丨王多鱼排版丨水成文自 CRISPR-Cas9 基因组编辑技术问世以来,人们为拓展其应用范围付出了大量努力,从而开发出了碱基编辑器(Base editor,BE)和先导编辑器(Prime editor,PE)。碱基编辑器能够转换单个或少数几个碱基,而先导编辑器能够引入碱基替换以及小的片段插入和缺失。由于其灵活性和精准性,先导编辑器在包括细胞和基因治疗以及疾病建模在内的治疗应用方面正受到越来越多的关注。然而,先导编辑器受限于其较低的编辑效率,因此,人们探索了各种策略以提高先导编辑效率。2025 年 8 月 5 日,首尔国立大学医学院的研究人员在国际顶尖学术期刊 Cell 上发表了题为:AI-generated MLH1 small binder improves prime editing efficiency 的研究论文。该研究利用 David Baker 团队开发的 AI 蛋白质设计工具——RFdiffusion,设计了靶向抑制错配修复(MMR)通路的 MLH1 小型结合蛋白(MLH1-SB),并使用 AlphaFold3 从设计的候选蛋白中高效筛选最佳蛋白——一个仅由 82 个氨基酸组成的 MLH1-SB,其可与当前的各种先导编辑器兼容适配,在人类细胞和小鼠体内大幅提高先导编辑效率。这项研究凸显了生成式人工智能(generative AI)在推进基因组编辑技术方面的巨大潜力。最后,研究团队表示,生成式人工智能(generative AI)工具的快速发展正在改变学术界和产业界的研究格局。该研究中使用了便捷的网页版 RFdiffusion,仅用 3 天时间就快速生成了 MLH1-SB,而且无需本地高算力支持,此外,使用 AlphaFold3 高效筛选蛋白,只用了 1 天时间,整个过程仅花费 4 天时间。这种高成功率、高效率,大大缩短了后续实验所需的时间和成本。论文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)00799-8设置星标,不错过精彩推文

来源:命好的小熊

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