Cell：粪菌移植的安全性受质疑，或产生长期、意料之外的负面健康后果

摘要：粪菌移植（FMT）是一种日益常用的干预手段，通过将健康人粪便中的微生物移植到病人体内，以期恢复其肠道菌群的健康平衡。然而，粪便中的微生物主要是来自结肠（大肠的一部分）的厌氧微生物，这些微生物在小肠或消化系统的其他部位定植时，可能会导致肠道生态系统失衡。

撰文丨王聪

编辑丨王多鱼

排版丨水成文

粪菌移植（FMT）是一种日益常用的干预手段，通过将健康人粪便中的微生物移植到病人体内，以期恢复其肠道菌群的健康平衡。然而，粪便中的微生物主要是来自结肠（大肠的一部分）的厌氧微生物，这些微生物在小肠或消化系统的其他部位定植时，可能会导致肠道生态系统失衡。

实际上，美国 FDA 已经批准了粪菌移植（FMT）用于治疗复发性艰难梭菌感染，但其在其他疾病（包括肥胖症、自闭症、癌症和炎症性肠病）中的作用机制、疗效以及脱靶效应仍不清楚。有报道显示，接受 FMT 的患者曾出现过肠胃不适、败血症以及代谢问题（例如体重增加、溃疡性结肠炎病情加重等）。

2025 年 6 月 6 日，芝加哥大学、中西大学及香港中文大学的研究人员合作，在国际顶尖学术期刊Cell上发表了题为： Microbiome mismatches from microbiota transplants lead to persistent off-target metabolic and immunomodulatory effects 的研究论文。

这项研究提醒我们，粪菌移植（FMT）要慎重，它可能会给接受者带来长期的、意料之外的负面健康后果。

具体来说，粪菌移植（FMT）过程中可能会出现区域微生物植入不匹配的情况，FMT 中来自结肠的厌氧微生物会在移植后定植于小肠，进而改造小肠环境，使其对自己有利，这会改变肠道区域生态系统的本质和特性，对健康、代谢、行为和能量平衡产生负面影响。

该研究还表明，相比口服途径（或上消化道内镜途径），通过结肠镜途径进行粪菌移植（FMT），可能有助于避免产生意料之外的后果。

粪菌移植（FMT）是一种日益常用的干预手段，但鉴于其主要由厌氧菌组成，其是否适合恢复肠道区域微生物群，尤其是小肠（ small bowel ）的微生物群，这一点值得怀疑。

在这项最新研究中，研究团队在接受通过上消化道内镜进行粪菌移植的人类受试者中，观察到在 4 周后十二指肠内厌氧菌定植。研究团队推测，经过口腔的粪菌移植（FMT）会造成宿主-微生物不匹配，从而影响小肠稳态。

为了验证这一点，研究团队给经过抗生素处理的无特定病原体（SPF）小鼠分别移植空肠菌移植（ JMT ）、盲肠菌移植（ CMT ）或粪菌移植（ FMT ），并在 1 个月或 3 个月后进行研究。空肠是小肠的第一部分；盲肠连接小肠和大肠，其中混合了来自小肠和大肠的为横屋。

结果显示，JMT 和 FMT 改变了区域微生物群的成员构成和功能、能量平衡以及肠道和肝脏的转录组；JMT 更有利于宿主的代谢途径，而 FMT 更有利于免疫途径。菌群移植驱动了区域肠道身份（

Gata4、Gata6Satb2）以及下游分化标志物。对经过代谢物处理的人类肠道类器官和粪菌移植（FMT）后的十二指肠活检组织进行 RNA 测序（RNA-seq），证实了小鼠体内转录水平的变化。

也就是说，移植后不匹配的微生物会改变肠道局部区域的代谢产物，这可能会对宿主产生健康影响，例如影响肝脏代谢，还会影响小鼠的饮食行为、活动量，产生能量消耗的差异。更重要的是，不匹配的微生物还会重塑组织特异性，重塑肠道内壁的基因表达水平，使其更接近微生物原本所处肠道区域的表达水平，也就是说，将原本处于大肠的微生物移植到了小肠，这些微生物会将小肠改造得更像适合自己的大肠的环境。

这些结果表明，粪菌移植（FMT）后的区域微生物不匹配，可能会导致意外后果，因此，需要重新思考基于微生物组的干预措施。