华南农业大学发表昆虫细胞色素P450数据库,助力昆虫解毒代谢研究

B站影视 2025-01-16 17:06 3

摘要:近日,华南农业大学植物保护学院/绿色农药全国重点实验室金丰良/庞锐团队在国际知名学术期刊《Molecular Ecology Resources》(中科院一区Top,IF5year = 7.8)上在线发表了题为"Insect Cytochrome P450 D

近日,华南农业大学植物保护学院/绿色农药全国重点实验室金丰良/庞锐团队在国际知名学术期刊《Molecular Ecology Resources》(中科院一区Top,IF5year = 7.8)上在线发表了题为"Insect Cytochrome P450 Database: An Integrated Resource of Genetic Diversity, Evolution and Function"的研究论文。该研究通过广泛收集和分析昆虫基因数据,构建了目前昆虫学领域最为广泛、全面且标准化的综合昆虫解毒代谢核心基因细胞色素P450信息平台。这为昆虫抗药性的形成与适应性进化研究提供了重要资源。

昆虫是地球上数量最多、种类最丰富的动物群体,对农业生产和粮食安全产生直接影响。细胞色素P450在昆虫体内负责代谢植物化感物质、杀虫剂和环境污染物,并在昆虫抗药性的形成以及昆虫与植物之间的相互作用中发挥着至关重要的作用。该基因家族在植物保护与害虫防治中也具有重要意义。

随着测序技术的发展和成本的降低,越来越多的昆虫完成了全基因组测序,发现了大量的P450基因。然而,这些P450基因的数据缺乏统一的格式标准以及深度的信息挖掘。本研究从682种昆虫的高质量基因组中识别出P450基因家族。通过对这些重新识别的P450基因进行注释、系统发育分析和结构解析,研究团队构建了昆虫细胞色素P450数据库(ICPD),提供关于昆虫P450多样性和结构特征的综合数据。此外,ICPD支持蛋白质结构的交互式可视化,以及分子对接、突变蛋白结构预测和蛋白质结构相似性计算等服务。

该数据库旨在为学术界及相关领域的用户提供以下两方面的支持:(1) 一个关于昆虫P450基因家族的免费且用户友好的资源库;(2) 一个允许用户比较多个P450蛋白结构的工具,并能够使用任意化学分子构建配体对接。这些资源和工具将大大促进对昆虫P450基因多样性和进化的研究,同时有助于P450酶的挖掘与功能分析,对未来新杀虫剂的设计具有重要价值

华南农业大学植物保护学院/绿色农药全国重点实验室是该论文的第一完成单位。华南农业大学植物保护学院的博士生吴洪鑫与中山大学生命科学学院的硕士生李钟晟为论文的共同第一作者。庞锐副研究员和金丰良研究员是该论文的共同通讯作者。参与本研究的还有植物保护学院许小霞教授、硕士生钟梓春、郭玉静、何柳燕,以及数学与信息学院/软件学院的毛宜军讲师和唐德玉教授。此外,中山大学生命科学学院的张文庆教授也参与了研究。本研究得到了国家重点研发计划经费和数据空间技术与系统全国重点实验室开放基金的资助。

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来源:中国农药工业协会

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