Cell丨一种结合CRISPR筛选和空间转录组学的新方法—Perturb-FISH
传统的CRISPR筛选技术(如Perturb-seq)结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)能够分析基因扰动后的转录组变化,但缺乏空间信息,无法解析细胞微环境对基因表达的影响。而光学池筛选(如MERFISH,多重荧光原位杂交技术)虽能提供高分辨率空间转录组
传统的CRISPR筛选技术(如Perturb-seq)结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)能够分析基因扰动后的转录组变化,但缺乏空间信息,无法解析细胞微环境对基因表达的影响。而光学池筛选(如MERFISH,多重荧光原位杂交技术)虽能提供高分辨率空间转录组
每种细胞类型都拥有独特的基因表达模式,以维持其功能和应对外部信号。这种特异性依赖于转录调控网络,而目前人类细胞中这些网络的结构尚未完全阐明【1-2】。精准的基因调控对于维持细胞身份和响应环境信号至关重要,而T细胞作为免疫系统中功能多样的细胞类型,其基因表达的精