【农科智库原创报告】基于SCI论文的肉鸡育种领域基础研究态势分析

摘要：本文以WOS核心集SCIE数据库为数据源，以肉鸡及相关育种技术为检索词，主要涉及杂交育种及其他传统育种、全基因组关联育种、分子标记辅助育种、转基因育种、细胞工程育种、基因编辑育种、分子（模块）设计育种、功能基因挖掘、数量性状基因座挖掘等育种技术的相关词汇，并基

一、数据来源及研究方法

本文以WOS核心集SCIE数据库为数据源，以肉鸡及相关育种技术为检索词，主要涉及杂交育种及其他传统育种、全基因组关联育种、分子标记辅助育种、转基因育种、细胞工程育种、基因编辑育种、分子（模块）设计育种、功能基因挖掘、数量性状基因座挖掘等育种技术的相关词汇，并基于此构建出初始检索式，文献检索时间范围设置在2012-2021年区间，通过人工判读，发现初始检索结果中杂项较多，因此对检索式进行修改与完善，最终检索式见附录，共检索到911条数据。

通过对年度发文量进行处理，分析领域的研究历程。利用InCites 与VOSviewer对研究主体的产出表现及合作情况进行分析。同时，利用CiteSpace对数据进行处理，通过关键词聚类、时间线图、突现词分布等，呈现该领域的研发布局、研究热点、新兴主题等，并对热点主题与关键技术进行深入解读，以更好的分析其发展态势。

二、研究历程

对论文年度发文量进行分析，可以明确该研究领域的发展趋势与发展阶段。由图1可知，肉鸡育种技术在2012-2016年间，每年以60-75篇论文产出，保持在平稳发展状态。2017年开始快速增长，2019年达到近年来的最高峰121篇，随后开始下降，2021年降至99篇，只比2017年的94篇多5篇。

根据发展趋势，肉鸡育种技术近十年的发展可分为三个阶段：2012-2016年为平稳发展阶段，2017-2019年为快速增长阶段，2020-2021年为缓慢回落阶段。在平稳发展阶段，论文发文量在60-75篇上下波动，肉鸡育种部分领域开始发展，比如动物福利、免疫应答、肠道微生物等相关方向。但是受制于技术水平，很多方向并未受到重点关注，直到快速增长阶段的2017-2019年。该阶段，基因育种技术发展快速，比如GLUP技术、SNP、RNA技术等，2012-2016年的部分研究方向出现论文的快速产出。

图1 肉鸡育种领域论文产出年度分布

三、主要研究国家

2012-2021年，许多国家在肉鸡育种技术方面有论文产出。在发文量排名前10的国家中，中国以242篇位居榜首，其次为英国（182篇）、美国（158篇）。其他7个国家发文量均不到100篇（具体见表1）。

表1 肉鸡育种技术论文产出TOP10国家

图2 肉鸡育种技术论文产出TOP10国家发文趋势

从图2年度发文趋势可以分出，可以将肉鸡育种领域论文产出TOP10的国家分成三个梯队：第一梯队为中国，呈现波动-快速增长-回落-增长趋势。其中2016-2018年呈现快速增长趋势，从13篇快速增至2018年的35篇，远高于同时期其他国家。2019-2020年出现小幅回落后，2021年又呈现增长趋势，达到近年来全球最高发文量41篇。第二梯队为英国和美国。这两个国家整体发文趋势均为波动型，2019年两个国家均出现一定范围的增长趋势，其后开始回落，年度发文量稳定在10-26篇范围内。第三梯队为其余的7个国家，年度发文量明显低于第一、第二梯队，且一直处于平稳态势。

由表1可知，2012-2021年，中国整体论文产出虽属最多，但是篇均被引频次却低于美国（21.82）、澳大利亚（17.82）、德国（16.91）、荷兰（16.70）、韩国（14.23），位列第6名。同时结合CNCI值分析，中国（CNCI为0.95）处于TOP10国家的第7名，仅高于印度（0.77）和巴西（0.76），显著低于英国的1.88。说明中国肉鸡育种领域论文影响力与美国、澳大利亚、英国等国家具有一定得差距，仍有较大提升空间。

从国际和国内合作占比分析，中国国内合作占比明显高于国际合作占比，这与欧美国家的英国、美国、德国、荷兰等明显不同。以英国为例，其国际合作占比高达65.12%，而国内合作占比仅有25.16%；中国国内合作占比为43.8%，而国际合作占比仅有17.36%，因此后续科研过程中，中国可加大国际合作的力度，提升论文影响力。

通过国家合著网络可以看出，中国与美国位于网络中心位置，中心度较高，中国主要与印度、巴基斯坦、埃及等国家合作密切；美国与巴西、法国、应该、波兰等国家合作相对密切。

四、主要研究机构

据统计，在2012-2021年论文量的机构排名中，中国农业科学院以71篇发文量排名第一，是第二名爱丁堡大学（38篇）、英国科研创新办公室（38篇）的近2倍。入选TOP10机构中，同属于中国大陆的另一个机构为中国农业大学，该机构以30篇论文产出，与荷兰的瓦格宁根大学并列第六名。从产出机构所属国家分析，TOP10机构中英国占据4所，其次是中国大陆2所，剩余的埃及、美国、法国各占据1所。

表2 肉鸡育种技术论文产出TOP10机构

此外，在排名前10的机构中，近三年发文量占比，埃及知识库论文产出占比最高（0.69），其次为瓦格宁根大学0.47、中国农业科学院0.44，其余机构均低于0.4。说明大部分机构近三年发文量均较少。篇均被引方面，TOP10机构可以分成三个梯队：第一梯队法国国家农业食品与环境研究院，CNCI为39.24，是唯一一所篇均被引超过30的机构。第二梯队篇均被引在20～30范围内，有佐治亚大学系统（25.16）、英国生物技术与生物科学研究委员会（24）、爱丁堡大学（23.76）、英国科研创新办公室（23.47）、罗斯林研究所（23.23）。第三梯度篇均被引在20以下，有4所机构，分别是瓦格宁根大学（17.97）、中国农业科学院（12.92）、中国农业大学（11.83）和埃及知识库（5.65）。此外根据CNCI数值统筹分析，论文整体影响力最强的为法国国家农业食品与环境研究院，篇均被引和CNCI数值均排名第一。其次为佐治亚大学系统，篇均被引和CNCI数值均排名第二。隶属中国大陆的中国农业科学院和中国农业大学，虽然论文产出高于上述两所机构，但是论文影响力排名靠后，说明中国大陆在论文质量方面还需进一步提升。

通过VOSviewer绘制出机构合著网络，可以发现，美国科宝公司公司（Cobb Vantress inc）与佐治亚大学（Univ Georgia）、奥尔胡斯大学（Aarhus Uni）合作次数最多，爱荷华州立大学（Iowa state Univ）、特拉华大学（Delaware Univ）合作次数也较多，相比之下，国外机构之间合作相对紧密，而国内机构与国外机构合作相对较少。

五、研发布局

（1）全球研究布局

通过CiteSpace，本文对全部论文进行主题聚类，以分析肉鸡育种技术在全球的研究布局。本次聚类Q值为0.4794，S值为0.7408（一般而言Q值大于0.3，社团结构显著；S值在0.7以上聚类是可信的），说明聚类结构显著，聚类可信度高，聚类结果如图3所示。

图3 2012-2021年肉鸡育种技术全球研究布局

由图3可知，2012-2021年肉鸡育种技术全球研究布局重点聚焦5大主题，分别是：肉质（meat quality）、本地品种（native breeds）、基因表达（gene expression）遗传参数（genetic parameter）、育种价值（breeding value）、单步法GBLUP（single-step gblup）。其中，肉质（meat quality）主题主要关键词包括胴体性状（carcass characteristics）、代谢（metabolism）、生长表现（growth performance）、基因型（genotype）；本地品种（native breeds）主题主要关键包括单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism）、数量性状基因位点（quantitative trait loci）、胴体（carcass）、diet（饮食）、muscle（肌肉）；基因表达（gene expression）主题主要关键词包括基因表达（gene expression）、体重（baby weight）、胴体性状（carcass trait）、表现（performance）；遗传参数（genetic parameter）主题主要关键词包括遗传参数（genetic parameter）、肉鸡（broiler breeder）、免疫应答（immune response）、产蛋量（egg production）、胚胎发育（embryonic development）；育种价值（breeding value）主题主要关键词包括鉴定（idenfication）、细胞（cell）、基因组（genome）、疫病（disease）、准确性（accuracy）、选择（selection）、候选基因（candidate gene）。

（2）中国研究布局

对中国发表的论文进行主题聚类，展现肉鸡育种技术在中国的研究布局，并与全球研究布局进行对比分析。本次聚类Q值为0.6055，S值为0.8271，说明聚类结构显著，聚类可信度高，聚类结果如图4所示。

图4 2012-2021年肉鸡育种技术中国研究布局

由图4可知，2012-2021年肉鸡育种技术中国研究布局重点聚焦7大主题，分别是：生长表现（grownth performance）、免疫原性（immunogenicity）、性成熟（sexual maturity）、关联分析（association analysis）、微生物群（microbiota）、胴体产量（carcass yield）、抗菌素耐药性（antimicrobial resistance）。生长表现（grownth performance）主题主要关键词包括肉质（meat quality）、基因表达（gene expression）、生长表现（growth performance）、代谢（metabolism）、蛋白（protein）、骨骼肌（skeletal muscle）。免疫原性（immunogenicity）主题主要关键词包括肉鸡（broiler）、选择（seleciton）、激化蛋白酶（activated protein kinase）。性成熟（sexual maturity）主题主要关键词包括体重（body weight）、品质（quality）。关联分析（association analysis）主题主要关键词包括表达（expression）、胴体性状（carcass trait）、身体构成（bady composition）、关联分析（association analysis）、腹部脂肪（abdominal fat）。微生物群（microbiota）主题主要关键词包括序列（sequence）、免疫应答（immune response）。胴体产量（carcass yield）主题主要关键词包括候选基因（candidate gene）、变异（mutation）。抗菌素耐药性（antimicrobial resistance）主题主要关键词包括菌株（strain）、抗菌素耐药性（antimicrobial resistance）。

比较分析可以得出，中国和全球在肉鸡育种领域，都对基因育种技术、肉质品质关注度高，但中国同时对于通过育种提高繁殖力、生长性状、抗病等方向保持着较高的科研产出。

六、研究热点

利用CiteSpace对节点的热度及中心度进行展现（见图5），从而进一步明确该领域的研究热点与前沿。节点面积越大，表示中心性越大，热度越高。一般认为具有较高热度与中心性的节点是较为重要的研究主题。

图5 2012-2021年肉鸡育种技术热点主题分布

同时，将各个主题簇及其节点通过时间线图呈现（见图6），可以深入了解不同主题出现的时间节点及其发展态势。由图可知，对基因表达、生长态势、肉质等方向的研究自2012年以来一直是学者关注的重点，且这些研究方向也具有较高的中心性；同时2012年就出现了动物福利关键词，成为持续的热点。2013年出现代谢、免疫等关键词，同时肠道微生物成为关注点，热度持续到2021年；2014年开始对基因育种技术增加了关注，包括候选基因、核苷酸多态性、诱变育种等多次出现，且热点持续；2015年科研工作者开始关注系统因素对育种工作的影响，包括热应激的育种改良、饲料成分的生长的改善等方面；2016年免疫应答开始成为关注热点，多次出现immune response、antibody response等相关主题。

图6 2012-2021年肉鸡育种技术时间线图

此外，文献被引频次的高低是该文献参考应用价值和学术影响力的体现，被引次数越多表明对学术交流和研究产生的贡献越大。通过对被引频次TOP2%的文献进行深入内容分析，然后结合聚类结果对检索结果被引频次TOP20%的文献进行分析，可以发现，全基因组关联分析方法、遗传调控、肠道微生物改善、肉质等是长期以来学者较为关注的主题。

结合时间线图与近十年关键词的突现分布情况（见图7），可见基因育种技术、环境因素、福利等是近三年新兴与学者重点关注的研究重点。

图7 2012-2021年肉鸡育种技术关键词突现图谱

七、结论

通过构建肉鸡育种检索式和提取相关数据，获得肉鸡育种领域的研发布局、研究热点、新兴主题等，得出以下结论：

（1）宏观发展态势方面：

1）发文数量：中国以242篇位居榜首，其次为英国和美国。虽然中国整体论文产出最多，但是篇均被引频次却低于美国（21.82）及其他国家，位列第6名。结合CNCI数值，中国（CNCI为0.95）处于TOP10国家的第7名，显著低于英国的1.88。说明中国肉鸡育种领域论文影响力与美国、澳大利亚、英国等国家具有一定得差距，仍有较大提升空间。

2）国家合作：中国国内合作占比明显高于国际合作占比，这与欧美国家的英国、美国、德国、荷兰等明显不同。在后续科研过程中，中国可加大国际合作的力度，提升论文影响力。通过国家合著网络可以看出，中国与美国位于网络中心位置，中心度较高，中国主要与印度、巴基斯坦、埃及等国家合作密切；美国与巴西、法国、应该、波兰等国家合作相对密切。

3）机构布局：中国农业科学院以71篇发文量排名第一，是第二名爱丁堡大学（38篇）、英国科研创新办公室（38篇）的近2倍。国内入选TOP10的另一个机构为中国农业大学，与荷兰的瓦格宁根大学并列第六名。结合篇均被引和CNCI数值，TOP0机构中论文影响力最强的为法国国家农业食品与环境研究院，其次为佐治亚大学系统。中国农业科学院和中国农业大学，虽然论文产出高于上述两所机构，但是论文影响力排名靠后，说明中国在论文质量方面还需进一步提升。

4）机构合作：美国科宝公司公司与佐治亚大学、奥尔胡斯大学合作次数最多，爱荷华州立大学、特拉华大学合作次数也较多，相比之下，国内机构与国外机构合作相对较少。

（2）全球与中国技术研究方面：

1）全球技术布局：肉鸡育种领域全球布局聚焦5大主题，分别是肉质、本地品种、基因表达、遗传参数、育种价值、单步法GBLUP。从主题聚类结果可以看出，全球布局主要集中在基因育种技术、遗传调控、肉质品质方面。

2）中国技术布局：中国在肉鸡育种领域，重点聚焦7大主题，分别是生长表现、免疫原性、性成熟、关联分析、微生物群、胴体产量、抗菌素耐药性。从主题聚类结果可以得出，中国布局主要集中在生长性状、繁殖力、基因育种技术、肠道微生物、肉质、抗病育种等方向。比较分析可以得出，中国和全球在肉鸡育种领域，都对基因育种技术、肉质品质关注度高，但中国同时对于通过育种提高繁殖力、生长性状、抗病等方向保持着较高的科研产出。

基因育种技术、环境因素、动物福利等成为了近三年新兴与学者重点关注的研究重点。