摘要:体外下拉试验(In vitro pull-down assay)又称蛋白质下拉实验,主要用于研究蛋白质与蛋白质、蛋白质与核酸或其他生物分子之间的相互作用。在体外下拉试验中,通常将感兴趣的蛋白质(称为“诱饵”)固定在固相载体上,如琼脂糖珠或磁珠,然后将含有可能与
体外下拉试验(In vitro pull-down assay)又称蛋白质下拉实验,主要用于研究蛋白质与蛋白质、蛋白质与核酸或其他生物分子之间的相互作用。在体外下拉试验中,通常将感兴趣的蛋白质(称为“诱饵”)固定在固相载体上,如琼脂糖珠或磁珠,然后将含有可能与诱饵蛋白相互作用的其他蛋白质(称为“靶”)的溶液加入反应体系中。通过洗涤和分离,未结合的蛋白质被去除,而结合的靶蛋白则被“拉下”并固定在固相载体上。后续通过电泳和质谱等分析手段,可以鉴定出与诱饵蛋白相互作用的靶蛋白。体外下拉试验通过模拟细胞内复杂的生物环境,帮助科学家揭示分子间的相互作用机制,从而为理解生命过程提供信息。体外下拉试验的应用非常广泛。其不仅可用于确认已知的蛋白质相互作用,还可以用于发现新的相互作用网络。此外,体外下拉试验还可以帮助研究蛋白质复合物的组成,从而揭示复杂生物功能的分子基础。例如,在信号传导研究中,体外下拉试验可用于鉴定参与特定信号通路的组成分子,从而为靶向治疗提供线索。
一、体外下拉试验分析步骤
1、准备:获取高纯度的目标蛋白,可通过原核或真核表达系统进行重组表达、纯化;选择合适的亲和标签(常见的有 GST、His 标签等)标记目标蛋白,准备对应的固相载体;制备细胞裂解液,其含有丰富的细胞内源性蛋白质,作为潜在相互作用蛋白的来源。
2、固定目标蛋白:将带有亲和标签的目标蛋白与固相载体孵育,使二者特异性结合,从而将目标蛋白固定在载体表面。例如,GST 融合蛋白与 GST 亲和树脂结合,形成固定化的 “诱饵”。
3、孵育与结合:把固定有目标蛋白的固相载体放入细胞裂解液中,在适宜的温度(常为 4℃)、时长(数小时至过夜)条件下缓慢摇动孵育,促进可能存在的相互作用蛋白与目标蛋白结合。
4、洗涤:孵育结束后,使用缓冲液多次洗涤固相载体,目的是洗去未与目标蛋白结合的杂蛋白,减少背景干扰,这一步骤对结果的特异性至关重要。
5、洗脱:运用合适的洗脱试剂(如含游离亲和标签的溶液、高盐缓冲液、改变 pH 的缓冲液等)将结合在目标蛋白上的相互作用蛋白从固相载体上洗脱下来。
6、检测:采用 Western blot、SDS - PAGE 电泳、质谱分析等手段对洗脱下来的蛋白进行鉴定和分析。
来源:老妖聊科学