【农科智库编译】西班牙发布种子发芽转录调控新见解

摘要：西班牙农业基因组学研究中心着手研究了在种子到幼苗的转变过程中转录何时重新启动的问题。这项研究描述了拟南芥增强子元素的鉴定，界定了编码和非编码转录在种子发芽关键阶段的范围和作用，扩大了学界对植物发育过渡转录机制的理解，有望为研究非编码基因组在种子发芽控制中的调控

西班牙农业基因组学研究中心着手研究了在种子到幼苗的转变过程中转录何时重新启动的问题。这项研究描述了拟南芥增强子元素的鉴定，界定了编码和非编码转录在种子发芽关键阶段的范围和作用，扩大了学界对植物发育过渡转录机制的理解，有望为研究非编码基因组在种子发芽控制中的调控作用开辟新的途径。

研究团队应用创新的RNA测序和生物成像方法，利用模式植物拟南芥监测种子萌发和幼苗早期生长过程中新RNA合成（新生转录）的动态。这种方法能够在种子重新水合后非常迅速地检测RNA转录，这意味着转录重新开始的时间比预期的要早得多。所用方法的敏感性还允许鉴定数千种以前未标记的非编码RNA。这些发现可能为研究非编码基因组在种子发芽控制中的调节作用开辟新的途径。研究团队还生成了相同发芽时间过程的全基因组染色质可及性的数据集。通过过滤基因组中可进入染色质区域的不稳定的非编码转录物，研究者能够检测到重要的调控特征，如双向转录和转录增强子。相关研究成果已发表于《Nature Communications》。

原文来源：CRAG、Nature

编译：北京市农林科学院数据科学与农业经济研究所