摘要:同源重组修复(HRR)是DNA双链断裂(DSB)的首选修复方式。同源重组修复缺陷(HRD)通常指细胞水平上的HRR功能障碍状态,可由HRR相关基因胚系突变或体细胞突变以及表观遗传失活等诸多因素导致,常存在于多种恶性肿瘤中,其中在卵巢癌、乳腺癌等肿瘤中尤其突出。
引言
同源重组修复(HRR)是DNA双链断裂(DSB)的首选修复方式。同源重组修复缺陷(HRD)通常指细胞水平上的HRR功能障碍状态,可由HRR相关基因胚系突变或体细胞突变以及表观遗传失活等诸多因素导致,常存在于多种恶性肿瘤中,其中在卵巢癌、乳腺癌等肿瘤中尤其突出。HRD会产生特定的、可量化的、稳定的基因组改变,可通过建立基于基因组特征分析的评估体系来预测肿瘤HRD状态及其程度,已成为晚期卵巢癌患者临床应用聚腺苷二磷酸核糖聚合酶抑制剂(PARPi)的新型生物标志物1研究背景
HRD状态的评估对于预测卵巢癌患者对PARPi的敏感性至关重要,因此临床指南建议对卵巢癌(OC)患者进行HRD状态评估。然而,HRD检测复杂且在大多数发展中国家的OC患者中难以获得或无法负担。因此,OC中HRD的发生率仍然未知2研究方法
本研究使用实验室开发的检测方法(HRD Insight,Gene Solutions,越南)检测了77名越南晚期OC患者的HRD状态。从福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本中提取肿瘤DNA,然后进行下一代测序以检测BRCA1和BRCA2基因中的有害或疑似有害突变。进行浅层全基因组测序,以通过评估大规模染色体内拷贝数的改变确定全基因组不稳定性(wGI)评分。
研究结果
HRD检测的成功率为94.8%(73/77),最小输入为8 ng DNA。在73名OC患者中,HRD阳性状态的发现率为54.8%(40/73)。BRCA1/2突变率为19.2%(14/73),而通过高wGI评分确定的基因组不稳定性比率为47.9%(35/73)。为了分析验证,HRD Insight检测与包括TruSight Oncology 500 HRD(Illumina)、SOPHiA DDM HRD Solutions(Sophia Genetics)和HRD Focus Panel(AmoyDx)在内的商业试剂盒进行基准比较,以确定44个样本的HRD状态。与3个试剂盒相比,实验室开发的检测方法显示出94.6%的一致率,阳性百分比一致性和阴性百分比一致性分别为96.4%和92.9%。
研究结论
HRD Insight检测可以准确可靠地确定HRD状态,以帮助医生为OC患者选择获批的PARPi2。讨论
恶性肿瘤中 HRD 的发生率与肿瘤部位、组织学类型及其所采用的检测方法密切相关。TCGA 计划研究组整合分析高级别浆液性卵巢癌中的316例全外显子组和489例表达谱数据,发现22%存在BRCA1/2胚系和(或)体细胞致病性或可能致病性突变,11%因启动子甲基化发生BRCA1 mRNA表达缺失,高达50%的卵巢癌可能存在HRR通路异常。该数据与越南卵巢癌患者HRD阳性率相似。
鉴于HRD在晚期卵巢癌患者中的高发生率,HRD检测具有重要的临床应用价值,可实现对卵巢癌患者进行分层,优化相应治疗决策,最大限度扩大PARPi临床获益人群。我国尚无获批的HRD检测试剂,临床实施检测时应依据患者肿瘤类型、分期与诊疗史,并在患者充分知情同意前提下,选择与适应证和(或)拟应用的PARPi种类最匹配且经严格性能验证的商业试剂盒1审批编号:CN-150243
过期日期:2025-12-15
参考文献:
1. 中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会遗传性肿瘤标志物协作组,中华医学会病理学分会分子病理学组. 同源重组修复缺陷临床检测与应用专家共识(2021版)[J]. 中国癌症防治杂志,2021,13(4):329-338.
2. Nam H. Tran, et al. Homologous recombination deficiency testing in Vietnamese patients with ovarian cancer. ESMO Asia 2024. Abstract 379MO.
来源:小易聊情感