摘要:研究方案中「关键实验技术(手段)」的系统性学习和理解,将极大提升你对研究方案的把控能力和设计能力,运筹帷幄,决胜千里,以不变应万变。
巧妇难为无米之炊。工欲善其事必先利其器。
研究方案中「关键实验技术(手段)」的系统性学习和理解,将极大提升你对研究方案的把控能力和设计能力,运筹帷幄,决胜千里,以不变应万变。
例如你知道 WB 的实验目的是什么吗?难道只是检测表达水平?那么 WB 能定量计算蛋白丰度吗?如果能那为何又有 ELISA 这种技术?
技术之间有互补性
技术之间,是相互互补的,又不可替代,这需要进一步地理解和学习。理解关键实验技术(手段)的原理特点和实验目的,和可能的实验结论,有助于研究方案的创新和优化。
给大家进行了总结,有不足之处请在留言区留言,协助我们更正:
1. 检测 RNA 分子在组织和细胞空间分布和表达丰度的技术:活细胞动态 RNA 成像技术、单分子 RNA FISH 原位杂交、多分子 RNA Scope 原位杂交技术、细胞核-细胞质分离结合 qPCR、单细胞测序技术、空间转录组技术、Northern blot、dot blot 等等;
2. 检测蛋白分子的空间分布和表达丰度的技术:免疫荧光、免疫组化、细胞核-细胞质分离结合 WB、GFP 标签融合蛋白示踪技术、空间蛋白质组学等等;
3. 检测 DNA 拷贝数、突变与否的技术:FISH 原位杂交、qPCR、基因组测序等等。
4. 检测某蛋白分子总的表达量(不含空间信息):ELISA 技术(定量)、western blot 技术(半定量,不准确);
5. 检测某蛋白分子的分子量大小(不含空间信息):分子筛层析法、western blot 技术、双向 2D 电泳、质谱分析等等;
6. 检测某蛋白分子的高级结构信息:蛋白结晶后冷冻电镜解析高级结构、分子对接分析等等;
7. 分子表达干预技术:分子克隆操纵表达技术、病毒载体过表达或者敲减表达(shRNA、siRNA)、点突变技术、CRISPR 敲除或者敲入技术、CRISPRi 沉默技术、功能区分段(truncate)敲除技术、靶蛋白小分子抑制剂或者单抗抑制剂等等;
8. 体内水平探索分子功能:类器官、PDX 模型、裸鼠皮下成瘤、各种 XXX 疾病动物模型、活体成像技术等;
9. 细胞功能探索:细胞增殖、细胞周期检测、细胞衰老、细胞干性、细胞分化、细胞凋亡、细胞焦亡、炎症风暴、迁移、侵袭能力,表面受体表达等等;亚细胞结构的囊泡和细胞器的分离和电镜影像学观察;
10. 分子间互作实验方法:RNA、DNA、蛋白之间的互作分析技术如下图;
11. 新疾病分子、通路的寻找:蛋白质组学、代谢组学、全转录组测序、生物信息学分析等等;
关键技术上,也要量力而为,一定要符合本单位的硬件技术设施定位,且不可为了新而新,写一些天马行空,脱离实际的技术手段上去,评审专家也会提出质疑。
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来源:老钱的科学课堂